Stoianoglo este învinuit de abuz de serviciu săvârșit în interesul unei organizații criminale. Mai exact, acesta ar fi contribuit la eliberarea din pușcărie a lui Veaceslav Platon prin renunțarea ilegală, de către Procuratură, la învinuire. Potrivit unui comunicat al Procuraturii Generale, bugetul public ar fi fost prejudiciat cu peste 870 de milioane de lei. Stoianoglo este acuzat și de corupere pasivă, prin primirea de la Platon a peste 63 de milioane de lei. El este suspectat și de fals în declarații prin neincluderea în declarația de avere și interese personale a faptul că soția sa este unul dintre beneficiarii unei firme înregistrate în Ucraina. Urmărirea penală este încheiată și în privința a doi procurori de la PCCOCS, bănuiți că au acționat împreună cu Stoianoglo la eliberarea lui Platon. Stoianoglo neagă toate acuzațiile.